Swoje prace naukowe i archeologiczne Baer publikował w wydawnictwach naszej Akademii Nauk, do której od początku lat 30. XX wieku niepodzielnie należała jego działalność. W antropologii Baer uznał duże znaczenie badań kraniologicznych; kilka jego wspomnień (np. „Sgapia Zeiesia”, „O czaszkach Rzymian retyckich”, „O czaszkach Vendian”, „O kolekcji czaszek Akademii Tukya”, „O makrogłowach Krymu i Austrii” itp.) poświęconych jest tej tematyce. Zawsze ostrożny w swoich wnioskach, Baer rzadko decydował się na ustalenie, do jakiego plemienia należy ta czy tamta czaszka, a zadowalał się jedynie określeniem, do jakiego plemienia nie może należeć znana czaszka, czyli dochodzeniem do negatywnego wniosku. Uważał nawet, że nauka nie może obecnie dać innego pozytywnego wyniku. Ta ostrożność we wnioskach może być nadal dobrą lekcją dla tych antropologów, którym spieszy się z wyciąganiem obszernych wniosków historycznych z kilku zamierzeń kranometru.... Oprócz badań antropologicznych Baer prowadził badania archeologiczne. Z jego inicjatywy Akademia Nauk pozyskała od słynnego duńskiego archeologa Worso pozostałe rysunki Muzeum Starożytności Północy w Kopenhadze i opublikowała je z rosyjską przedmową tego samego Baera. Jednocześnie Baer sporządził projekt wyprawy archeologiczno-etnograficznej do Rosji, po której spodziewał się tak bogatych wyników, zarówno w zakresie wyjaśnienia starożytnego stanu ludzkości, jak i zwłaszcza tego okresu w historii ziemi rosyjskiej, o którym milczą inne zabytki. druga - „O starożytnym stanie człowieka w Europie. Wspomnienia te uzupełniają się, a jednocześnie są najlepszym popularyzatorskim przedstawieniem tematu; najlepszym, ponieważ uwzględniają bogaty materiał dostarczony przez ziemię rosyjską... Nawet bardziej niż archeolog Baer był etnografem; sam odbył kilka podróży (do Nowej Ziemi, na daleką północ, do Morza Kaspijskiego); za namową odbyły się ważne przedsięwzięcia turystyczne w Middendorfie, Castrenie i węgierskich Regulach i przy wszelkiego rodzaju wsparciu naszego naukowca. W odniesieniu do geografii i etnografii nazwisko Baera cieszy się zasłużonym zaszczytem: razem.
CHRNICALERA NESTORA
z acad. Helmersena i opublikował 26 tomów Veiigyde gig Keppipsh (ez Vmzzrzschep VeisNz, w którym znajduje się wiele jego artykułów etnograficznych, m.in.: „O osiągnięciach Piotra V. w upowszechnianiu wiedzy geograficznej”, „O prastarej bezdrzewności południa”, stepach rosyjskich, „Na ruinach Majara” itp. Beer przedstawił swoje koncepcje „o wpływie przyrody zewnętrznej, stosunkach społecznych poszczególnych ludów” oraz historię ludzkości w odrębnym pamiętniku pod tym samym tytułem. Konkluzja, do której dochodzi, jest następująca: „Los narodu jest zdeterminowany z góry i niejako nieuchronnie przez charakter zajmowanego przez niego obszaru. Kiedy oś Ziemi przesunęła się ku swemu nachyleniu, woda oddzieliła się od lądu, podniosły się pasma górskie i kraje rozdzieliły się od siebie – los rodzaju ludzkiego został już z góry przesądzony, a historia świata jest niczym innym jak spełnieniem tego z góry ustalonego losu”. Historyk dopuszczający pewną dozę swobody w poruszeniach ducha ludzkiego nie może zgodzić się z taką konkluzją, niemniej jednak same wspomnienia Baera nie tracą swojego pierwotnego znaczenia; przynajmniej w całej literaturze europejskiej nie sposób wskazać dzieł, które w tak niewielkim tomie zmieściłyby w sobie tak bogactwo błyskotliwych myśli i rozważań. W ostatnim okresie życia Baer zajmował się szeregiem nowych zagadnień historycznych i etnograficznych, które starał się zgłębić w dwóch ostatnich tomach swoich „Dzieł drobnych”11. Szczególnie interesujący jest tom trzeci, który zawiera „Rozwiązanie niektórych zagadnień historycznych za pomocą nauk przyrodniczych”11. Przygody Odyseusza, o których mowa w X i XI księgach Homera, jego zdaniem dość wyraźnie wskazują miejscowości Morze Czarne, Zatoka Laestrigońska. odpowiada zatoce Balaklava. Jeszcze ważniejszy dla nas jest artykuł poświęcony „starożytnemu szlakowi handlowemu czarnomorskich Skgyuys do Azji wewnętrznej”. Herodot (IV, 21 - 25) opowiada o ludach, które żyły na północ i wschód od Scytów, przekazuje pewne cechy dotyczące ich sposobu życia, charakteru krajów, że ostatnimi znanymi ludami są Argipejczycy, że jedzą owoc zwany pontyjski. Biorąc pod uwagę wszystkie cechy przyrodniczo-historyczne i geograficzne odnotowane przez Herodota, Baer dochodzi do wniosku, że kraj Argipejczyków leżał w Azji Środkowej, sąsiadując z takim regionem. Chiński Turkiestan. Baer śledź szczegółowo w latach 1873-77