Переможеного повстанського вождя, однак, не було піддано повному жорстокому вироку; цілком ймовірно, через помилку або через жалість його ката. Підтвердженням цьому є те, що кат отримав ноут, йому відрізали язик і відправили довічно в Сибір. Пугачов був спочатку обезголовлений (21 січня 1775 року), а потім четвертований, а різні частини його тіла були виставлені на головних воротах міста. Частину його спільників також було страчено, а інших заслано до Сибіру. Інші, серед них Антізоф, були зайняті утихомиренням своїх співвітчизників. Плата за охорону кордонів, тимчасово припинена, щоб покрити витрати на турецьку війну, була відновлена серед орд ой лайків; і все, на час, заспокоїлося.
Таким був кінець цього повстання, яке протягом вісімнадцяти місяців було причиною величезних втрат, спалення численних і квітучих міст, повного знищення трьохсот п’ятдесяти районів, розграбування великих провінцій, винищення понад 350 000 людей і вимирання кількох дворянських родин.
Особливим розпорядженням було вирішено, щоб місто Лайцкой, біля якого був головний осередок повстання, надалі називалося Уральською; і р. лайк, Уральськ; натякаючи на великі ланцюги гір з такою назвою, від підніжжя яких вона тече до північного берега Каспійського моря.